Llegar a Holbox por tu cuenta tiene tres tramos: de Cancún al pueblo portuario de Chiquilá en autobús ADO o en coche, y luego un ferry que cruza la laguna. El ferry es la parte fija: la travesía dura 25 minutos y salen barcos cada 30 minutos durante todo el día, operados por Holbox Express y 9 Hermanos.
El tramo por carretera es el largo. ADO cubre el autobús Cancún–Chiquilá; compra los billetes en la terminal de autobuses de Cancún o en línea, y consulta el horario antes de planificar el día, porque solo unos pocos autobuses al día hacen el trayecto. En coche, aparcas en Chiquilá, donde los aparcamientos privados junto al muelle cobran por día, y cruzas como pasajero a pie: el coche se queda en tierra firme, y en Holbox la gente se mueve a pie, en bici o en carrito de golf.
Salvo que salgas de Cancún antes del amanecer, llegas a la isla cuando los barcos de snorkel ya se han ido: el barco de los tiburones ballena sale de Marina VIP Holbox a las 6:30 y los tours al arrecife recogen a las 7:45–8:00. Esa es toda la razón para dormir en Holbox.
